Index B | C | D | E | F | G | I | L | M | O | P | R | S | T | V B BFXPipeline (class in bionty) bionty module Bionty (class in bionty) BiontyField (class in bionty) BioSample (class in bionty) C CellLine (class in bionty) CellMarker (class in bionty) CellType (class in bionty) D DevelopmentalStage (class in bionty) df() (bionty.BFXPipeline method) (bionty.Bionty method) (bionty.Species method) diff() (bionty.Bionty method) Disease (class in bionty) display_available_sources() (in module bionty) display_currently_used_sources() (in module bionty) Drug (class in bionty) E Ethnicity (class in bionty) ExperimentalFactor (class in bionty) F fields (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute) G Gene (class in bionty) get_term() (bionty.Ontology method) I inspect() (bionty.Bionty method) L LOCAL_SOURCES (in module bionty) lookup() (bionty.Bionty method) M map_legacy_ids() (bionty.Gene method) map_synonyms() (bionty.Bionty method) module bionty O Ontology (class in bionty) P Pathway (class in bionty) Phenotype (class in bionty) Protein (class in bionty) R reset_sources() (in module bionty) S search() (bionty.Bionty method) source (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute) species (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute) Species (class in bionty) standardize() (bionty.Bionty method) T Tissue (class in bionty) to_df() (bionty.Ontology method) V validate() (bionty.Bionty method) version (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Species attribute) (bionty.Tissue attribute)